Mahfut, Mahfut and Daryono, Budi Setiadi and Somowiyarjo, Susamto (2017) Deteksi Odontoglossum ringspot virus pada Anggrek Asli Koleksi Kebun Raya di Indonesia. Jurnal Fitopatologi Indonesia, 12 (1). pp. 1-8. ISSN 0215-7950

Preview

Text 16358-49234-1-PB.pdf - Published Version Download (316kB) | Preview

Abstract

Anggrek asli merupakan salah satu kekayaan flora asli Indonesia yang memiliki peran penting sebagai induk persilangan dalam pemuliaan tanaman anggrek. Infeksi virus menjadi salah satu faktor pembatas dalam budi daya anggrek. Penelitian bertujuan mendeteksi dan mengidentifikasi Odontoglossum ringspot virus (ORSV) yang menginfeksi anggrek asli. Sampel dikoleksi dari tanaman bergejala asal 5 kebun raya di Indonesia, yaitu Bogor, Cibodas, Purwodadi, Balikpapan, dan Enrekang. Deteksi dan identifikasi dilakukan secara serologi menggunakan antiserum spesifik ORSV, dilanjutkan dengan metode reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR), dan perunutan DNA. Uji serologi menunjukkan 5 sampel bereaksi positif terhadap antiserum ORSV, yaitu pada Phalaenopsis amboinensis (KRB2) dan Phalaenopsis amabilis (KRB12) dari Kebun Raya Bogor, Phalaenopsis amabilis (KRP18) dan Dendrobium salacence (KRP20) dari Kebun Raya Purwodadi, dan Phalaenopsis modesta J. J. Sm. (KRBp5) dari Kebun Raya Balikpapan. Deteksi asam nukleat 5 sampel tersebut dengan RT-PCR menggunakan primer spesifik gen coat protein ORSV menghasilkan fragmen DNA berukuran ± 474 pb. Analisis homologi 5 isolat ORSV tersebut menunjukkan nilai indeks similaritas (IS) sebesar 99.8% dengan 14 isolat ORSV lain. Analisis filogenetika menunjukkan isolat KRB2 dan isolat KRP18 berada dalam satu kelompok dan terpisah dengan isolat ORSV dari negara-negara lain. Ini adalah laporan pertama adanya infeksi ORSV pada anggrek asli koleksi 5 kebun raya di Indonesia.

Item Type:	Article
Subjects:	Q Science > QK Botany S Agriculture > S Agriculture (General)
Divisions:	Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) > Prodi Biologi
Depositing User:	MAHFUT - -
Date Deposited:	14 May 2019 07:57
Last Modified:	14 May 2019 07:57
URI:	http://repository.lppm.unila.ac.id/id/eprint/12543

Actions (login required)

View Item