Herasari, Dian and Ilim, Ilim and Pandiangan, Kamisah Delilawati and Rilyanti, Mita and Satria, Heri (2018) Studi Stabilitas dan Aktivitas Lipase Isolat Manuk (lipMNK) dalam Pelarut Asetonitril dengan Pendekatan Simulasi Dinamika Molekul. In: SEMIRATA 2018 Bidang MIPA Wilayah Barat, 4-6 May 2018, INDONESIA. (Unpublished)

Text Semirata2018-DianH.docx Download (15kB)

Abstract

Lipase Manuk (lipMNK) adalah lipase dengan lid ganda dari mikroorganisme termofilik, Geobacillus uzenencis, yang diperoleh dari kawah Manuk, Garut, Jawa Barat, Indonesia. Mekanisme katalisis lipase melibatkan pergerakan dinamis segmen lid dari keadaan lid tertutup menjadi keadaan lid terbuka. Salah satu faktor yang mempengaruhi dinamika konformasi segmen lid adalah polaritas pelarut. Beberapa penelitian menunjukkan bahwa adanya asetonitril dalam konsentrasi tertentu dapat meningkatkan aktivitas lipase. Pada penelitian ini, dipelajari efek penambahan asetonitril terhadap stabilitas dan aktivitas lipMNK pada level atom dengan pendekatan simulasi dinamika molekul (MD). MD dilakukan dengan menggunakan perangkat lunak AMBER, force field ff03.r1. temperatur 358K selama 100 ns simulasi. Hasil penelitian menyarankan bahwa struktur lipMNK nampak stabil pada rentang asetonitril hingga 70%. Konsentrasi asetonitril 20% merupakan konsentrasi terbaik dari sisi stabilitas maupun aktvitas lipMNK. Gerakan pembukaan dan penutupan lid lipMNK berlangsung melalui mekanisme yang berbeda. Pada gerakan pembukaan lid kedua segmen lid bergerak bersamaan, sedangkan gerakan penutupan lid diinisiasi oleh segmen lid kecil

Item Type:	Conference or Workshop Item (Speech)
Subjects:	Q Science > QD Chemistry
Divisions:	Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) > Prodi Magister Ilmu Kimia
Depositing User:	Dr. Eng. Heri Satria
Date Deposited:	21 Jun 2018 02:16
Last Modified:	21 Jun 2018 02:16
URI:	http://repository.lppm.unila.ac.id/id/eprint/7118

Actions (login required)

View Item