Silitonga, Fetrilisa and Aliah, Ratu Siti and Yudha, Indra Gumay (2018) Analisis Keragaman Genetik Tiga Varietas Udang Galah, Macrobrachium rosenbergii (de Man, 1879) Menggunakan Penanda DNA Mitokondria. Zoo Indonesia. ISSN 0215-191X (Submitted)

[img] Text
JURNAL FETRILISA.pdf

Download (209kB)
Official URL: http://e-journal.biologi.lipi.go.id/index.php/zoo_...

Abstract

Syarat dilakukan persilangan yaitu tersedianya indukan yang berbeda secara genetik. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragamangenetik tigavarietasudang galah(populasi aceh, populasi solo, dan strain siratu) mengunakan metode RFLP. Genom mtDNA diekstrak menggunakan metode phenol-chloroform, diamplifikasi dengan teknikpolymerase chain reaction(PCR)primer yang igunakan yaitu COI (forward5’ACGCAACGGTGGCTTTTC-3’danreverse5’-TAGTTAGCTGTTAGGGGGAT-3’) dan primer16SrDNA(forward5’-GGTAATTTGACCGTGCGAAG-3’dan reverse5’-ACCAGCTAAACG GCT ACACCT-3’). Produk PCR COI sepanjang 1516 pasang basa (bp) direstriksi dengan menggunakan 5 enzim (AvaII, MspI, RsaI, HaeIII, danTaqI)dan16S rDNA sepanjang 444 pasang basa (bp) meng-gunakan enzimMboI, MspI, Sau3AII, HaeIII, danTaqI). Hasil penelitian menunjukkan pada regionCOI terdapat 22haplotipe, sedangkan pada region16S rDNA menunjukkan 2haplotipe. Berdasarkan ada tidaknya situs restiksi pada masing-masing mtDNA, diperoleh nilai keragaman genetik pada mtDNA COI populasi aceh0,836, strain siratu 0,829 dan populasi solo 0,517, sedangkanpadamtDNA 16S rDNApopulasi aceh0,488, strain siratu 0,066 dan populasi solo 0. Jarak genetik menggunakan region COI dan 16S rDNA menunjukkan bahwa populasi aceh-solo yang tertinggi (jauh) dengan nilai berturut-turut 0,0800 dan 0,6170.

Item Type: Article
Subjects: S Agriculture > SH Aquaculture. Fisheries. Angling
Divisions: Fakultas Pertanian (FP) > Prodi Sumberdaya Akuatik
Depositing User: INDRA GUMAY YUDHA
Date Deposited: 12 Nov 2018 03:06
Last Modified: 12 Nov 2018 03:06
URI: http://repository.lppm.unila.ac.id/id/eprint/9754

Actions (login required)

View Item View Item