Wardiyanto, Wardiyanto
KLONASI PARSIAL GEN AMP (ANTI MICROBIAL PEPTIDE) DAN GEN MX DARI IKAN KERAPU TIKUS (Cromileptes altivelis).
In: Semirata BKS-PTN Wilayah Barat Bidang Ilmu Pertanian, Banka Belitung.
(Submitted)
Abstract
KLONASI PARSIAL GEN AMP (ANTI MICROBIAL PEPTIDE) DAN GEN MX DARI IKAN KERAPU TIKUS (Cromileptes altivelis)
Wardiyanto*
Dosen Jurusan Perikanan dan Kelautan Fakultas Pertanian Universitas Lampung
Jl.Prof.S.Brodjonegoro No.1 Gedong Meneng Bandar Lampung 35145
*Penulis untuk korespondensi wardibdifp@gmail.com
ABSTRAK
Penyakit infeksi yang disebabkan oleh bakteri dan virus masih menjadi permasalahan pada marikultur kerapu tikus (Cromileptes altivelis) di Indonesia. Peningkatkan sistem imun kerapu tikus secara alami yang berkaitan dengan imunitas bawaan dan pencegahan replikasi virus dengan perantaraan gen-gen terkait menjadi pendekatan baru untuk mengurangi infeksi patogen yang dapat dilakukan dengan klonasi gen. Penelitian dilakukan untuk mempelajari kehadiran gen AMP dan Mx dari kerapu tikus dan kesamaan secara bioinformatik gen tersebut dibandingkan dengan sekuen nukleotida dari jenis kerapu lainnya yang lebih dulu ditemukan. Metode penelitian klonasi gen AMP dan Mx dilakukan secara parsial dengan menggunakan teknik PCR dilanjutkan dengan pembacaan basa nukleotida (nucleotide sequensing) dan pengurutan/pensejajaran basa nukleotida secara bersamaan (nucleotide alignment). Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen AMP dan gen Mx dari kerapu tikus memiliki kesamaan 85,3% dan 86,9 % dengan urutan basa nukleotida kerapu (Epinephelus coioides, E.lanceolatus). Prediksi bentuk tiga dimensi susunan asam amino secara sintetis dari kedua gen tersebut juga menunjukkan kemiripan bentuk yang menunjukkan kemungkinan kesamaan mekanisme fungsi kedua gen untuk menghambat infeksi penyakit.
Kata kunci: bioinformatika, kerapu tikus, gen AMP, gen Mx, klonasi
Available Versions of this Item
-
KLONASI PARSIAL GEN AMP (ANTI MICROBIAL PEPTIDE) DAN GEN MX DARI IKAN KERAPU TIKUS (Cromileptes altivelis). (deposited 16 Nov 2017 07:22)
[Currently Displayed]
Actions (login required)
|
View Item |