Herasari, Dian and Hertadi, Rukman and Warganegara, Fida Madayanti and Akhmaloka, Akhmaloka (2018) EFEK GERAK LID LipMNK : KOMPARASI JEMBATAN GARAM. In: Seminar Nasional Hasil-Hasil Pengabdian Kepada Masyarakat 2018, Rabu, 14 November 2018, Hotel Bukit Randu Bandar Lampung. (Unpublished)

[img] Text
BukitRandu-dian.pdf

Download (1MB)

Abstract

LipMNK merupakan lipase yang diperoleh dari mikroorganisme termofilik Geobacillu suzenencis isolat Kawah Manuk daerah Garut Jawa Barat. Aktivitas katalitik lipase sangat ditentukan oleh perubahan konformasi lipase akibat pergerakan segmen lid, dari keadaan konformasi lid tertutup (c-lipMNK) menjadi konformasi lid terbuka (o-lipMNK). Pada penelitian ini diamati perubahan jembatan garam yang terdapat pada masing-masing keadaan konformasi lipMNK. Pada keadaan konformasi lid yang tertutup, c-lipMNK terdapat 18 pasang jembatan garam. Struktur o-lipMNK mempunyai 21 pasang jembatan garam, dimana 13 pasang jembatan garam sama dengan c-lipMNK, dua residu berganti pasangan membentuk jembatan garam, dan terbentuk enam pasang jembatan garam baru menggantikan tiga pasang jembatan garam yang hilang pada c-lipMNK. Simulasi dinamika molekul selama 20 ns memperlihatkan 11 pasang jembatan garam pada o-lipMNK dan lima pasang jembatan garam pada c-lipMNK yang tetap terjaga sepanjang simulasi. Dari keseluruhan interaksi elektrostatik tersebut hanya tiga pasang jembatan garam yang tetap terjaga pada perubahan konformasi dari c-lipMNKmenjadi o-lipMNK. Perbedaan jembatan garam yang terlihat selama perubahan konformasi lid menyarankan dinamika struktur pada lipMNK. Kata Kunci : lipMNK, lid, jembatan garam, simulasi dinamika molekul

Item Type: Conference or Workshop Item (Speech)
Subjects: Q Science > QD Chemistry
Divisions: Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA) > Prodi Kimia
Depositing User: DR DIAN HERASARI
Date Deposited: 14 May 2019 08:30
Last Modified: 14 May 2019 08:30
URI: http://repository.lppm.unila.ac.id/id/eprint/12564

Actions (login required)

View Item View Item