Wardiyanto, Wardiyanto KLONASI PARSIAL GEN AMP (ANTI MICROBIAL PEPTIDE) DAN GEN MX DARI IKAN KERAPU TIKUS (Cromileptes altivelis). In: Semirata BKS-PTN Wilayah Barat Bidang Ilmu Pertanian, Banka Belitung.

Text #.WARDIYANTO-MAKALAH SEMIRATA BABEL 2017.doc.pdf Download (444kB)

Abstract

KLONASI PARSIAL GEN AMP (ANTI MICROBIAL PEPTIDE) DAN GEN MX DARI IKAN KERAPU TIKUS (Cromileptes altivelis) Wardiyanto* Dosen Jurusan Perikanan dan Kelautan Fakultas Pertanian Universitas Lampung Jl.Prof.S.Brodjonegoro No.1 Gedong Meneng Bandar Lampung 35145 *Penulis untuk korespondensi wardibdifp@gmail.com ABSTRAK Penyakit infeksi yang disebabkan oleh bakteri dan virus masih menjadi permasalahan pada marikultur kerapu tikus (Cromileptes altivelis) di Indonesia. Peningkatkan sistem imun kerapu tikus secara alami yang berkaitan dengan imunitas bawaan dan pencegahan replikasi virus dengan perantaraan gen-gen terkait menjadi pendekatan baru untuk mengurangi infeksi patogen yang dapat dilakukan dengan klonasi gen. Penelitian dilakukan untuk mempelajari kehadiran gen AMP dan Mx dari kerapu tikus dan kesamaan secara bioinformatik gen tersebut dibandingkan dengan sekuen nukleotida dari jenis kerapu lainnya yang lebih dulu ditemukan. Metode penelitian klonasi gen AMP dan Mx dilakukan secara parsial dengan menggunakan teknik PCR dilanjutkan dengan pembacaan basa nukleotida (nucleotide sequensing) dan pengurutan/pensejajaran basa nukleotida secara bersamaan (nucleotide alignment). Hasil penelitian menunjukkan bahwa gen AMP dan gen Mx dari kerapu tikus memiliki kesamaan 85,3% dan 86,9 % dengan urutan basa nukleotida kerapu (Epinephelus coioides, E.lanceolatus). Prediksi bentuk tiga dimensi susunan asam amino secara sintetis dari kedua gen tersebut juga menunjukkan kemiripan bentuk yang menunjukkan kemungkinan kesamaan mekanisme fungsi kedua gen untuk menghambat infeksi penyakit. Kata kunci: bioinformatika, kerapu tikus, gen AMP, gen Mx, klonasi

Item Type:	Conference or Workshop Item (Paper)
Subjects:	S Agriculture > SH Aquaculture. Fisheries. Angling
Divisions:	Fakultas Pertanian (FP) > Prodi Budidaya Perairan
Depositing User:	WARDIYANTO
Date Deposited:	09 May 2019 03:07
Last Modified:	09 May 2019 03:07
URI:	http://repository.lppm.unila.ac.id/id/eprint/11728

Available Versions of this Item

• KLONASI PARSIAL GEN AMP (ANTI MICROBIAL PEPTIDE) DAN GEN MX DARI IKAN KERAPU TIKUS (Cromileptes altivelis). (deposited 16 Nov 2017 07:22)
  • KLONASI PARSIAL GEN AMP (ANTI MICROBIAL PEPTIDE) DAN GEN MX DARI IKAN KERAPU TIKUS (Cromileptes altivelis). (deposited 09 May 2019 03:07) [Currently Displayed]

Actions (login required)

View Item